O Departamento de Patologia da Faculdade de Ciências Médicas (FCM) da Unicamp foi instituído a partir da fusão de dois Departamentos existentes (Departamento de Anatomia Patológica (DAP) e Departamento de Patologia Clínica (DPC)), em cumprimento às normas vigentes da Universidade quanto à estrutura departamental de suas Unidades, sendo sua proposta de criação aprovada pela Congregação da FCM em 25/10/2019 e posteriormente pelo Conselho Universitário (CONSU) da Unicamp em 24/11/2020. Desta forma, o Departamento de Patologia conta com duas grandes áreas:
A criação do Departamento de Patologia possibilitou uma melhor integração em diversas disciplinas preexistentes nos departamentos de origem, ministradas por docentes das diferentes subespecialidades de cada área. Estas disciplinas são regularmente oferecidas para alunos de graduação e pós-graduação da FCM e de outras Unidades da Unicamp.
Em relação às atividades de pesquisa, a aproximação dos interesses científicos dos docentes fortaleceu a parceria no desenvolvimento de projetos de pesquisa, dando continuidade aos projetos em andamento, financiados pela própria Unicamp e por agências nacionais de financiamento (FAPESP e CNPq).